抗生素耐药性的研究冻土的菌株
大约一半的抗生素耐药菌株获得最初的选择后,为进一步的工作选择。其中我们发现53株30株革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。对于这些压力我们坚决抵制所有的光谱抗生素以前(公里、通用、Sm、Tc厘米)。这不仅分析显示菌株耐一个抗生素,而且耐两个和三个不同的抗生素。与双菌株的频率抗生素耐药性在Grampositive和革兰氏阴性细菌都超过了20%,而三重抗的菌株被发现只有在革兰氏阴性细菌20%频率(Mindlin等人。,2008)。
25株四株革兰氏阴性细菌和革兰氏阳性细菌,他们中的大多数对至少两个抗生素,被选出的阻力因素的详细分析(表2)。所有的系统发育关系隔离使用16 s rRNA基因测序可以识别10株属于假单胞菌属,八不动杆菌,两Stenotrophomonas,两个Sphingomonas菌株,四株属于Paenibacillus属革兰氏阳性。其余三个菌株被发现属于黄,分别Psychrobacter和Brevundimonas属(表2)。
为每个这些压力我们决心抵抗的光谱广泛的抗生素(beta-lactams、氨基糖甙类、四环素、磺胺药物,甲氧苄氨嘧啶和喹诺酮类),其中包括期间使用的第一步选择。此外,我们确定的汞抗性菌株。耐药菌株对不同抗菌药物的敏感性是由琼脂扩散和琼脂稀释方法使用Mueller-Hinton琼脂[平井伯昌et al ., 1986;安德鲁斯,2007]。这一分析显示,在大多数冻土研究菌株对抗生素不同的类(表2)。例如,应变的MR29-12 Psychrobacter psychrophilus是同时抗链霉素、四环素和甲氧苄氨嘧啶;不动杆菌的菌株MR5-8 sp.五抗生素都有耐药性(美联社,厘米,通用,公里,结核病);和不动杆菌菌株ED23-35 sp.同时抵抗HgCl2和链霉素。有趣的是,独立的隔离程序(特定抗生素的存在与否在隔离),许多菌株同时对两个或两个以上的结构无关的抗生素。作为一个例子,应变的Pseudomonasputida提基孤立没有抗菌药物同时抵抗HgCl2,羧苄青霉素,氯霉素、链霉素和甲氧苄氨嘧啶,属于不同的抗菌药物的类(表2)。
压力指示 |
Region1 |
年龄(YBP) 2 |
分类地位 |
耐药模式 |
ED23-35 |
一个 |
我5-40K |
不动杆菌sp。 |
Hg, Sm |
ED45-25 |
一个 |
我5-40K |
不动杆菌sp。 |
Hg, Sm |
M2-7 |
一个 |
我5-40K |
不动杆菌jonsonii |
据美联社、Hg、Tp |
MR5-8 |
一个 |
我5-40K |
不动杆菌sp。 |
美联社,厘米,通用,公里,结核病 |
MR5-11 |
一个 |
我5-40K |
不动杆菌sp。 |
美联社,厘米,Sm, Sp |
VS15 |
一个 |
2-3M |
不动杆菌sp。 |
美联社,厘米,Sm, Sp |
EK30A |
一个 |
即时通讯 |
不动杆菌sp。 |
美联社,Sm, Sp |
EK67 |
一个 |
2-3M |
不动杆菌sp。 |
美联社,Sm, Sp |
MR29-12 |
一个 |
i5-35K |
Psychrobacter psychrophilus |
Tc, Sm Tp |
MR7-1 |
一个 |
200 - 390 k |
Stenothrophomonas sp。 |
厘米,通用,Cb,公里,海里,Sp, Tc, Tp |
MR7-3 |
一个 |
200 - 390 k |
Stenothrophomonas maltophilia |
美联社,厘米,通用,公里,海里,Sp, Tp |
MR9-2 |
一个 |
15-40K |
黄retroflexus |
点,美联社,厘米,通用,公里,Nm, Sp, Tp吗 |
ED23-9 |
一个 |
15-40K |
Sphingomonas3 sp。 |
通用、公里、海里、Sm、结核病 |
EK42 |
B |
50 - 300 k |
Sphingomonas mucosissima |
(美联社),Sm |
ED23-10 |
一个 |
15-40K |
假单胞菌libanensis4 |
Cb、厘米、Hg、Sp、Tp |
ED23-26 |
一个 |
15-40K |
荧光假单胞菌 |
Cb,厘米,Hg,公里,Sp, Tp |
ed94 - 71 |
一个 |
15-40K |
假单胞菌(荧光) |
Cb,厘米,Hg,公里,Sp, Tp, |
EDM6-1 |
一个 |
15-40K |
假单胞菌sp。(荧光) |
Cb、Hg、Tp |
VS27 |
一个 |
3-5K |
假单胞菌sp。 |
厘米,Cb, Sm Tp |
VS38 |
一个 |
3-5K |
假单胞菌sp。 |
厘米,Cb, Sm, Sp,苏,Tc, Tp, Nal |
VS50 |
一个 |
3-5K |
假单胞菌sp。 |
厘米,Cb, Sm, Sp,苏,Tp |
VS51 |
一个 |
3-5K |
假单胞菌sp。 |
Sp,厘米,Cb, Sm Tp |
Tik1 |
一个 |
200 - 600 k |
假单胞菌putida |
Sp, Hg,厘米,Cb, Sm Tp |
Tik3 |
一个 |
200 - 600 k |
假单胞菌sp。 |
厘米,Sm, Sp,苏,Tp |
EK41 |
B |
50 - 300 k |
Brevundimonas vesicularis |
美联社,Sm |
MRI-1 |
一个 |
3-5K |
Paenibacillus amyloliticus |
Sm (Sp) |
VSH72 |
一个 |
200 - 600 k |
Paenibacillus amyloliticus |
(美联社),Sm |
VSH76 |
一个 |
200 - 600 k |
Paenibacillus amyloliticus |
Sm (Sp) |
EK63 |
B |
50 - 300 k |
Paenibacillus sp。 |
(美联社),Sm (Sp) |
抗生素使用名称和浓度(| g / ml):氨苄西林(美联社),-200;氯霉素(Cm), -20;庆大霉素(Gm), 5;HgCl2 (Hg), 5;羧苄青霉素(Cb), -400;卡那霉素(公里),-25 (50 - 200);萘啶酸(Nal), -20;新霉素(Nm), -25;链霉素(Sm)、-50 (100);奇霉素(Sp), -100; sulphathiazole (Su), -25; tobramycin (Tb), -40; tetracycline (Tc), -15; trimethoprim (Tp), -25. Resistance to Cb always acompany Ap-resistance; Parentheses indicate low-level resistance A-Arctic, B-Antarctic; Age in years现在之前(YBP)。K = 10年;M = 10年;Sphingomonas最初命名为假单胞菌paucimobilis但后来被重新分类到不同的物种在一个新的属Sphingomonas [Yabuuchi et al ., 1990);新物种假单胞菌、假单胞菌libanensis sp. 11月的一部分荧光假intrageneric集群(Dabboussi et al ., 1999);细菌属于Brevundimonas以前假单胞菌属的分类,但后来被包括进深深分支集群在干的革兰氏阴性细菌(人选,1995)。
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